由于每个孩子的体质不同，接种疫苗后可能会有一些轻微和严重的反应，主要是局部反应和全身反应，过敏反应很少。
局部反应:在安慰剂对照双盲实验中，接种疫苗最常见的副作用是接种部位疼痛(影响10-64%的患者)；接种流感疫苗等后可持续两天。接种疫苗后24小时内，接种者可以感觉到注射部位疼痛和压痛。这些反应通常是轻微且短暂的。在大多数情况下，它们会在2到3天内自动消失，无需进一步的医疗措施。
轻度不良事件:总体而言，受试者可以很好地耐受流感疫苗。这些疫苗是灭活的，也就是只含有没有传染性的病毒，显然不会致病。因此，接种疫苗后的呼吸道疾病是与流感疫苗无关的意外疾病。按性别分析的14项研究表明，女性(年轻或年老)报告的局部反应明显更多。
全身反应:也可出现轻度全身反应。以前没有接触过疫苗中抗原的人(例如儿童)可能会出现发烧、全身不适和肌痛。这些反应发生在接种疫苗后6-12小时内，一般持续1-2天。
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