输精管切除术有着悠久的历史，而且操作简单，是一种非常常见的小手术。然而，如果处理不当就会出现并发症。从近期来看，有出血和感染；从长远来看，有疼痛的结节、附睾抑郁症、性功能障碍和前列腺炎。常见的并发症有以下几种。
(1) 结扎后出血，一般在24小时内发生。外出血型是指血液向外流，容易被发现；内出血型根据血液积聚的部位不同，分为阴囊皮下淤血、精索血肿和阴囊血肿。出血的程度有轻有重，治疗要积极及时，更要注意预防。除了医生的关注外，患者也应密切配合，如术后不要过早参加重体力劳动和剧烈运动。凡是会对手术部位造成过度摩擦和牵拉，使线头脱落而引起出血的活动都应禁止。休息7天后可逐渐恢复工作。手术后，应避免性交约2周。
(2) 切口的感染和生殖系统的炎症。切口周围有炎症的迹象，如红、肿、热和疼痛。可分为切口感染、精索附睾炎、前列腺和精囊炎。
手术后应注意保护伤口，不要触碰敷料的敷料或清洗伤口。如上述症状严重，应到医院就诊。
(3) 疼痛性结节。有些病人术后在结扎部位出现疼痛的结节。当术后1个月以上结扎部位仍有局部疼痛、压痛和结节时，就可以诊断为疼痛性结节。这是一种由创伤引起的组织反应，大多数没有自觉症状。主要原因是结扎线和感染引起的慢性炎症，精索肉芽肿和神经纤维瘤样增生性结节。
(4)附睾凹陷。
(5)输精管皮肤瘘结扎后，在阴囊前壁可见直径约4-6mm的瘘孔，有精液和脓液溢出，挤压患侧睾丸时可见溢出量增加，显微镜下可见精子、脓球和白细胞。通过切除瘘管，结扎近端，缩小和重新定位，并放置引流条，瘘管很快就会愈合。
(6) 术后个人的性功能障碍主要是由心理因素引起的。
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